佛頂宮位于南京市江寧區(qū)牛首山遺址公園。牛首山遺址公園項(xiàng)目規(guī)劃設(shè)計(jì)范圍東至寧丹路，西至大谷線，北到江寧行政邊界，南到牛首祖堂景區(qū)分界線，總面積約10.8平方公里，其中核心區(qū)規(guī)劃設(shè)計(jì)范圍總面積約0.6平方公里。在規(guī)劃上確定了“天闕藏地宮，雙塔出五禪”、“一花五葉”的總體布局。
牛首山遺址公園從2012年開工建設(shè)，目前該工程已完成。