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    退火溫度

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      退火溫度(Annealing Temperature)[1] 為引物和模板結(jié)合時候的溫度參數(shù),當(dāng)50%的引物和互補(bǔ)序列表現(xiàn)為雙鏈DNA分子時的溫度.它是影響PCR特異性的較重要因素。在理想狀態(tài)下,退火溫度足夠低,以保證引物同目的序列有效退火, 同時還要足夠高,以減少非特異性結(jié)合。合理的退火溫度從55℃到70℃。退火溫度一般設(shè)定比引物的 Tm低5℃。
      在模板變性后溫度快速冷卻至40℃~60℃(某個退火溫度)的時候,可使引物和模板發(fā)生結(jié)合。由于模板DNA 比引物復(fù)雜得多,引物和模板之間的碰撞結(jié)合機(jī)會遠(yuǎn)遠(yuǎn)高于模板互補(bǔ)鏈之間的碰撞,這就使PCR后期的過程成為可能。
      退火溫度與時間,取決于引物的長度、堿基組成及其濃度,還有靶基序列的長度。對于20個核苷酸,G+C含量約50%的引物,55℃為選擇最適退火溫度的起點(diǎn)較為理想。引物的復(fù)性溫度可通過以下公式幫助選擇合適的溫度:
      Tm值(解鏈溫度)=4(G+C)+2(A+T)
      復(fù)性溫度=Tm值-(5~10℃)
      在Tm值允許范圍內(nèi), 選擇較高的復(fù)性溫度可大大減少引物和模板間的非特異性結(jié)合, 提高PCR反應(yīng)的特異性。復(fù)性時間一般為30~60sec,足以使引物與模板之間完全結(jié)合。
      在金屬加工領(lǐng)域,退火溫度是指退火時金屬應(yīng)加熱達(dá)到的溫度。據(jù)有關(guān)文獻(xiàn)介紹,不同金屬材料的退火溫度為:鉑,900—1000℃;銅,650℃;黃銅,600—650℃;鎳銀,650—680℃;鋁,283—350℃等。

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